国王的软弱加上贵族之间已经很明显的派系斗争倾向，导致 1450 年代贵族之间的局势紧张。经过近十年的酝酿，战争于 1460 年爆发。 玫瑰战争部分是由争夺王位控制权引起的，也源于贵族之间的家族忠诚、个人嫉妒、贪婪和野心。约克派军队很快取得了成功，约克公爵爱德华于 1461 年加冕为国王。亨利在这次失败中幸存下来，并在沃里克伯爵废黜爱德华后于 1470-71 年短暂地重新掌权。   然而，爱德华从勃艮第流亡返回英格兰，赢得了巴尼特和图克斯伯里战役，重新夺回了王位。 1471 年 5 月 21 日，爱德华四世凯旋重返伦敦，亨利六世在伦敦塔被谋杀。 爱德华将亨利的遗体在伦敦的圣保罗大教堂和黑衣修士教堂展出，然后将其埋葬在伯克郡切特西修道院的圣母堂。遗体一直留在那里，直到 1484 年理查三世将其挖出并重新埋葬在温莎的教堂。   亨利六世的一生是虔诚的典范，即使算不上睿智的君主。亨利的国王地位加强了他个人虔诚的影响。加冕仪式上，国王身穿达尔马提亚（一种执事的法衣），强调了英国君主制和教会的亲密关系。 4 亨利六世加冕后所具有的宗教特征，由于前任被封为圣徒而得到加强。忏悔者爱德华在十二世纪被封为圣徒，为英国君主制披上了神圣的光环。   另一个只有英国和法国国王才拥有的崇敬之因是，他们的臣民相信他们有能力治愈瘰疬（通常被称为国王的邪恶）。