1945年10月25日，青岛地区日军投降仪式在汇泉跑马场举行，陈宝仓中将与美国海军少将谢勃尔共同主持仪式 。图为日军投降代表长野荣二在投降书上签字后，呈上战刀。 陈宝仓在青岛的出色工作并未使他在国民党内平步青云。相反，因为派系倾轧，他曾被诬告有“资共”嫌疑而被免职 。这些经历让他对国民党的腐败深感失望。 1948年，陈宝仓在香港加入中国国民党革命委员会（民革），并与我党在香港的机构取得联系，政治信念彻底转向革命 。1949年，他接受中共华南局和民革中央的派遣，毅然赴台湾执行潜伏任务，配合我党在台重要情报工作人员吴石将军工作 。 他利用其“国防部”中将高参的身份，获取并手绘了大量涉及台湾防务的重要情报 。1950年初，因中共在台湾的省工委书记蔡孝乾被捕后叛变，导致吴石将军的身份暴露。国民党特务在搜查吴石住所时，发现了由陈宝仓亲笔手写的重要军事情报，陈宝仓随之被捕 。 在狱中，陈宝仓遭受酷刑，但始终坚贞不屈，咬定与吴石交换情报是正常的工作关系，保护了党的秘密和其他同志 。1950年6月10日，陈宝仓与吴石、朱谌之、聂曦四人被国民党特别军事法庭判处死刑，并在台北马场町刑场英勇就义 。就义前，他从容写下遗书，嘱咐友人告知家属“死后即用火葬” 。
