1978年夏末，美国航天局向王赣骏发函，正式通知他接受太空实验的飞行任务。1985年4月，他参加了“挑战者号”航天飞机的第17次飞行，成为了第一个进入太空的华人。 有趣的是，当时被NASA遴选为航天员的人，出发前按惯例可以带一面自己出生地的国旗上天，而当时海峡两岸为了争夺这一重要的时刻开始了角力。当时中国驻美大使馆,通过正式外交渠道向美国政府施压,不想让王赣骏携带“青天白日旗”,理由是那不是他出生地的"国旗"。而王赣骏最终选择了一个两不得罪的办法:他在公开申报的物品中带的是五星红旗，另外又把一面青天白日旗缝进了内裤。之后，他于1985年7月访问大陆时将五星红旗交给大陆，不久后又在去TW时将青天白日旗交给“行政院长”俞国华。
